世界首个GPU加速MD程序建立

作者： 2013年07月19日来源：浏览量：

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近日，中科院过程工程研究所高性能计算与化学信息学课题组建立了世界首个基于单GPU(图形处理器)加速的化学反应分子动力学（MD）程序GMD-Reax，其单节点计算能力（相比于8核CPU）比国际先进水平提升数倍。这将使煤热

近日，中科院过程工程研究所高性能计算与化学信息学课题组建立了世界首个基于单GPU(图形处理器)加速的化学反应分子动力学（MD）程序GMD-Reax，其单节点计算能力（相比于8核CPU）比国际先进水平提升数倍。这将使煤热解等复杂化学反应模拟成为可能。

　　近年来，将专门用于图像处理的GPU卡应用于分子动力学计算的尝试成为热点，但经典MD模拟的主要是分子体系的物理过程，不能应用于含化学反应的过程。应用量子力学（化学）方法从分子水平计算化学反应，其单一计算节点可应用规模只有数百个原子；国外科学家提出的化学反应力场ReaxFF与经典MD结合可提高到数千个原子。而如果利用GPU加速ReaxFF MD，则能提高到数万个原子甚至更多，从而使一些大规模体系的复杂化学反应（如煤热解）的模拟成为可能。

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